2月28日,国际微生物学期刊mBio报道了中科院海洋所孙超岷课题组关于深海难培养微生物-绿弯菌门(Chloroflexi)细菌纯培养及其通过光合作用获取光能的特殊能量代谢方式的研究成果,为突破深海难培养微生物的培养瓶颈提供了有效手段,也为深入了解深海重要微生物类群的特殊生命过程提供了研究材料。
孙超岷研究团队通过在基础培养基中添加利福平的方法富集培养了一批绿弯菌,通过不断传代培养,最终获得了3株绿弯菌纯培养。其中,有一株绿弯菌(命名为Phototrophicus methaneseepsis ZRK33)属于暂定纲 Thermofonsia分支2,该类群被推测可能是一类新型的光合细菌,但因为缺乏纯培养菌株一直未被证实。获得纯培养菌株后,研究人员通过16S rRNA基因和基因组进化分析等手段证实该菌株是一个新目分类阶元的代表菌株。基因组测序发现,该深海绿弯菌菌株有完整的光合作用通路,提示其可能有利用光能的潜力。进一步的实验表明不同光照尤其是红光能够促进该菌株的生长,证实了其利用光能的特性。利用转录组学手段揭示了在红光照射条件下,该菌株基因组中与光合作用相关的一系列关键因子的表达均得到了显著提升,证实了其通过光合作用方式利用光能。
基于利福平选择压力分离到一株深海绿弯菌
新分离的深海绿弯菌是一株新目分类阶元的代表菌株
具有光合特性的绿弯菌在深海冷泉和热液生境广泛分布